Zgodnie z art. 17 ust. 1 i 3 ustawy o gospodarce nieruchomościami Krajowa Informacja Skarbowa jako państwowa jednostka organizacyjna nieposiadająca osobowości prawnej, nabywając nieruchomości na własność lub użytkowanie wieczyste Skarbu Państwa, uzyskała do nabytych nieruchomości trwały zarząd.
Krajowa Informacja Skarbowa  posiada w trwałym zarządzie nieruchomości w lokalizacjach:
•    ul. J. Retingera 1, Będzin,
•    ul. R. Traugutta 2a, Bielsko-Biała,
•    ul. św. Jakuba 20, Toruń,
•    ul. Dekana 6, Leszno,
•    ul. 1 Maja 10, Płock.

W skład majątku KIS wchodzą także ruchomości.

Informacje dotyczące majątku Krajowej Informacji Skarbowej są dostępne w  publikowanych sprawozdaniach finansowych za poszczególne lata.